Skip to content

changelog.md

Latest commit

 

History

History
127 lines (124 loc) · 3.22 KB

changelog.md

File metadata and controls

127 lines (124 loc) · 3.22 KB
Raw

Changelog — Bioinformatica și Genomică Funcțională (BIOINF-Y4)

Toate schimbările notabile sunt documentate aici.

[0.1.0] – 2025-09-19

Added

  • Schelet inițial pentru laboratoarele de licență (anul IV).
  • Structură de bază: labs/, docs/.
  • README inițial cu denumirea completă a cursului.

[0.1.1] – 2025-09-19

Added

  • Dockerfile + requirements.txt (CPU-only).
  • .devcontainer/devcontainer.json folosind ``.

[0.1.2] – 2025-09-19

Added

  • CI: flake8 + script "smoke" rulate în containerul GHCR.

[0.1.3] – 2025-09-19

Added

  • README: badge-uri CI & Codespaces, link către Onboarding.
  • docs/onboarding.md: pași de start.

[0.1.4] – 2025-09-19

Added

  • LICENSE, docs/policies.md, docs/LICENSES.md, docs/GA4GH_primer.md, docs/resources.md, docs/GDPR_and_DataPolicy.md
  • Scripturi helper: dev.ps1, Makefile.

[0.2.0] – 2025-09-20

Added

  • Lab 02 — Aliniere de secvențe: notebook/script și materiale PDF (LFS).

[0.2.1] – 2025-09-20

Added

  • .flake8, .pre-commit-config.yaml, .dockerignore.
  • CONTRIBUTING.md, citation.cff.

[0.2.2] 2025-09-20

Added

  • Șabloane GitHub: issue și pull request.
  • Workflow publicare imagine: .github/workflows/publish.yml.

[0.3.0] 2025-09-20

Added

  • Lab 01 Introducere & Baze de date: materiale inițiale.

[0.3.1] 2025-09-20

Added

  • Lab 03 Formate & NGS: resurse și exerciții.

[0.3.2] 2025-09-20

Added

  • Lab 04 Filogenetică: notebook/script și materiale.

[0.3.3] 2025-09-20

Added

  • Lab 05 Clustering: cod și fișiere suport.

[0.3.4] 2025-09-20

Added

  • Lab 06 WGCNA: materiale și exemple.

[0.3.5] 2025-09-20

Added

  • Lab 07 Network Vizualization: structura

[0.3.6] 2025-09-20

Added

  • Lab 08 Federated Learning (Flower): demo și exerciții.

[0.3.7] 2025-09-20

Added

  • Lab 09 Drug repurposing: notebook/script și resurse.

[0.3.8] 2025-09-20

Added

  • Lab 10 Integrativ: materiale și exemple.

[0.3.9] 2025-09.20

Added

  • Lab 11 Multiomcs: structura

[0.4] 2025-09.20

Added

  • Lab 12 Generative AI: structura
  • Toate laboratoarele create

[0.4.1] 2025-09.20

Added

  • scripts/generate_licenses.py

Fixed

-docs/changelog.md

[0.4.2] 2025-09-20

Added

  • mlops/ utilitare MLflow și scripturi de logare.

[0.4.3] 2025-09-20

Added

  • docs/lab_onepagers/
  • docs/presentations/

[0.4.4] 2025-09-20

Fix CI

Modified

  • .github/workflows/ci.yml
  • .github/workflows/publish.yml

[0.4.5] 2025-09-20

Fix GCHR package name

Modified

-.devcontainer/devcontainer.json -dev.ps1 -docs/onboarding.md -labs/01_intro&databases/README_Lab1.md

[0.5.1] 2025-09-24

Complete lab 1

[0.5.2] 2025-09-24

Complete lab 2

[0.5.3] 2025-09-26

Complete lab 3

Modified

-labs/lab03_formats&NGS -ci.yml -.gitignore

[0.5.4] 2025-09-26

Complete lab 4

Added

-labs/lab04_phylogenetics

Modified

-ci.yml

[0.5.5] 2025-09-26

Complete lab 5

Added

-labs/lab05_clustering

Modified

-ci.yml

[0.5.6] 2025-09-26

Complete lab 6

Added

-labs/lab06_wgcna

Modified

-ci.yml

[0.5.7] 2025-09-26

Complete lab 7

Added

-labs/lab07_network_viz -ci.yml